從時(shí)間，研究進(jìn)展，安全和有效性等方面來(lái)說(shuō)，相比單克隆抗體、基于寡核苷酸的療法、血漿療法和肽等其他療法來(lái)說(shuō)，小分子藥物是最佳選擇。首先，新的干預(yù)措施可能需要數(shù)月至數(shù)年的開(kāi)發(fā)時(shí)間，無(wú)論從時(shí)間還是現(xiàn)有的研究進(jìn)度看，最有希望的就是小分子藥物療法了。其次，現(xiàn)有抗病毒藥具有已知的安全性特征以及對(duì)相關(guān)冠狀病毒的有效性，重新利用現(xiàn)有的小分子抗病毒藥物（“老藥新用”）是應(yīng)對(duì)SARS-CoV-2的一個(gè)重要的有前景的策略。如果可以把現(xiàn)有的藥物重定位，找到治療SARS-CoV-2感染的藥物，可以繞過(guò)臨床前研究（如動(dòng)物實(shí)驗(yàn)和藥理學(xué)研究）和早期臨床研究，直接進(jìn)入臨床2或3期。最后，有些小分子藥物還具有廣譜性。那針對(duì)小分子化合物類(lèi)抗病毒藥物的研發(fā)策略有哪些？

從眾多已有化合物或數(shù)據(jù)庫(kù)中，利用最新的研究方法，AI輔助進(jìn)行藥物篩選是一種重要的手段。這種策略的優(yōu)點(diǎn)在于能夠快速通過(guò)高通量篩選獲得大批潛在活性藥物，實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)也一定程度能反映出潛在藥物效力。

上?？萍即髮W(xué)饒子和/楊海濤課題組成功表達(dá)新冠病毒的一個(gè)關(guān)鍵蛋白酶——3CL水解酶（Mpro），并獲得了其晶體結(jié)構(gòu)。根據(jù)氨基酸序列對(duì)比，新型冠狀病毒與SARS病毒Mpro的相似程度為96%。因此，Mpro被作為抗擊新型冠狀病毒的重要靶點(diǎn)來(lái)進(jìn)行藥物的篩選。在此基礎(chǔ)上，上?？萍即髮W(xué)免疫化學(xué)研究所和中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所抗新冠狀病毒感染聯(lián)合應(yīng)急公關(guān)團(tuán)隊(duì)通過(guò)計(jì)算機(jī)虛擬篩選結(jié)合酶學(xué)檢測(cè)的方法，找到了30種可能對(duì)治療有作用的藥物或化合物，其中包括洛匹那韋、達(dá)蘆那韋、肉桂硫胺和環(huán)孢菌素A等抗病毒藥物。

華中科技、大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬武漢兒童醫(yī)院、西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院、中科院北京基因研究所、華為云聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)宣布，篩選出五種可能對(duì)2019新型冠狀病毒有效的抗病毒藥物。有：Beclabuvir，沙奎那韋(Saquinavir)，比特拉韋(Bictegravir)，洛匹那韋(Lopinavir)，多替拉韋(Dolutegravir)。其中，Beclabuvir可能是NSP12的一種潛在抑制劑。沙奎那韋（Saquinavir）和洛匹那韋（Lopinavir）則不僅可以很好地同Mpro蛋白結(jié)合，還能夠和2019新型冠狀病毒的S蛋白相結(jié)合，從而阻止S蛋白和ACE2受體的結(jié)合，因此可以同時(shí)在細(xì)胞內(nèi)部和表面阻止病毒的擴(kuò)增。洛匹那韋（Lopinavir）已經(jīng)被列入新型冠狀病毒臨床試驗(yàn)的登記列表中，比特拉韋（Bictegravir）和多替拉韋（Dolutegravir）是HIV病毒整合酶抑制劑，通過(guò)阻斷整合酶來(lái)抑制病毒的復(fù)制。

華中科技大學(xué)同濟(jì)藥學(xué)院李華教授、沈陽(yáng)藥科大學(xué)陳麗霞教授、軍事醫(yī)學(xué)研究院國(guó)家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心李行舟研究員等聯(lián)合研究表明，冠狀病毒nsp3編碼的木瓜樣蛋白酶(PLP)能夠幫助病毒基因組復(fù)制及逃避宿主抗病毒天然免疫，是藥物開(kāi)發(fā)的良好靶點(diǎn)。研究組模擬了新冠病毒PLP的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，找到了它的藥物結(jié)合口袋，同樣運(yùn)用計(jì)算機(jī)虛擬篩選方法，得到33個(gè)新冠病毒PLP的潛在抑制分子。

ACE2和TMPRSS2也是此次藥物篩選的重點(diǎn)靶標(biāo)，但是目前還沒(méi)有針對(duì)這兩個(gè)靶點(diǎn)的特異性藥物的研究報(bào)道，針對(duì)ACE2這一靶點(diǎn)的藥物也在緊張的測(cè)試中。目前，通過(guò)聯(lián)合團(tuán)隊(duì)的超大規(guī)模計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選結(jié)果顯示，沙奎那韋（Saquinavir）和洛匹那韋（Lopinavir）可能可以作用于ACE2，阻止病毒與細(xì)胞結(jié)合。

測(cè)試已知的藥物是否適用于此次的新冠病毒肺炎治療，對(duì)于已經(jīng)上市或者正在進(jìn)行臨床研究的藥物，潛在藥效，藥物代謝和副作用都較為明確，相對(duì)于研發(fā)新藥，這無(wú)疑大大縮短了研發(fā)和臨床測(cè)試的時(shí)間，減少投入，也增加了成功率。對(duì)于此次新冠肺炎疫情，重新測(cè)試那些用于抗擊埃博拉、SARS、艾滋病毒等致命病毒的藥物，已經(jīng)成為眾多科研學(xué)者和制藥公司正在采取的重要策咯。比如傳統(tǒng)用于治療冠狀病毒肺炎的干擾素，利巴韋林都屬于這一范疇。

治療SARS-CoV-2的潛在候選藥物主要分兩類(lèi)，靶向病毒的藥物和靶向宿主的藥物。目前在研的“老藥新用”清單（主要）：

一、病毒靶向藥物

1、已批準(zhǔn)的核苷類(lèi)似物（法匹拉韋（Favipiravir）和利巴韋林（Ribavirin））和實(shí)驗(yàn)性核苷類(lèi)似物（瑞德西韋（Remdesivir）和加利地韋Galidesivir）可能具有抗SARS-CoV-2的潛力。這些腺嘌呤或鳥(niǎo)嘌呤衍生物形式的核苷類(lèi)似物針對(duì)RNA依賴(lài)性RNA聚合酶（RdRp），它們被RdRP使用合成RNA鏈，但是在整合進(jìn)RNA鏈之后，能在廣泛的RNA病毒(包括人冠狀病毒)中阻斷病毒RNA的合成。

法匹拉韋是鳥(niǎo)嘌呤類(lèi)似物，近期的研究還報(bào)道它具有抗SARS-CoV-2的活性（在Vero E6細(xì)胞中的EC50=61.88?μM）。利巴韋林（Ribavirin）能否對(duì)SARS-CoV-2具有足夠的活性尚未得到確定。

瑞德西韋是由吉利德（Gilead）公司研發(fā)的新型實(shí)驗(yàn)性廣譜抗病毒藥物，腺嘌呤衍生物的氨基磷酸酯前藥，它的化學(xué)結(jié)構(gòu)類(lèi)似于已批準(zhǔn)的HIV逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑替諾福韋艾拉酚胺的化學(xué)結(jié)構(gòu)。該化合物是一種核苷類(lèi)似物，抑制RNA合成酶，主要干擾病毒RNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程，最近的一項(xiàng)研究報(bào)道，瑞德西韋可抑制SARS-CoV-2（Vero E6細(xì)胞中的EC50=0.77?μM），并且一名美國(guó)SARS-CoV-2患者在2020年1月接受靜脈注射瑞德西韋后康復(fù)了。針對(duì)瑞德西韋，2月初，兩項(xiàng)3期臨床試驗(yàn)已經(jīng)啟動(dòng)(NCT04252664和NCT04257656)，檢驗(yàn)瑞德西韋治療SARS-CoV-2感染患者的療效，預(yù)計(jì)在今年4月完成。

2、中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭旭舜團(tuán)隊(duì)則在bioRxiv 在線發(fā)表題為“Molecular Modeling Evaluation of the Binding Abilities of Ritonavir and Lopinavir to Wuhan Pneumonia Coronavirus Proteases5”的研究論文，揭示了克力芝抑制冠狀病毒的原理主要是由于利托那韋對(duì)冠狀病毒內(nèi)肽酶C30的抑制作用。雖然有其他的細(xì)胞學(xué)和動(dòng)物學(xué)研究表明，克立芝的抗冠狀病毒作用和肺部保護(hù)能力不如瑞德西韋，但是作為一款早在2000年就被美國(guó)FDA批準(zhǔn)上市的藥物，安全性相對(duì)更有保證。同時(shí)，洛匹那韋/利托那韋和干擾素-α2b聯(lián)合治療新冠病毒感染住院患者的療效和安全性的研究也已在中國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)中心注冊(cè)并在武漢市金銀潭醫(yī)院開(kāi)展（ChiCTR2000029308）。

3、許多其他試驗(yàn)也在中國(guó)正在開(kāi)展，以測(cè)試各種治療選擇，比如鹽酸阿比朵爾（Umifenovir）、奧司他韋（Oseltamivir）和ASC09F。據(jù)報(bào)道，已批準(zhǔn)的蛋白酶抑制劑，包括雙硫侖（Disulfiram）、洛匹那韋（Lopinavir）和利托那韋（Ritonavir）。其中洛匹那韋和利托那韋，科學(xué)家們也已啟動(dòng)臨床試驗(yàn)（ChiCTR2000029539）。

4、刺突糖蛋白也是一種有前景的靶標(biāo)。格瑞弗森（Griffithsin）是一種源自紅藻的凝集素，可與各種病毒糖蛋白（包括HIV糖蛋白120和SARS-CoV刺突糖蛋白）表面上的寡糖結(jié)合。然而作為治療或預(yù)防SARS-CoV-2的手段，它的效力和遞送系統(tǒng)仍然需要被重新評(píng)估。

二、宿主靶向試劑

1、已被批準(zhǔn)用于治療HBV和HCV的聚乙二醇化干擾素α-2a和-2b可能用于刺激SARS-CoV-2感染患者的先天性抗病毒反應(yīng)，并且涉及干擾素的臨床試驗(yàn)已經(jīng)啟動(dòng)，如已批準(zhǔn)的抗HCV藥物組合聚乙二醇化干擾素-利巴韋林進(jìn)行臨床試驗(yàn)（ChiCTR2000029387）。

2、已被批準(zhǔn)用于治療其他人類(lèi)疾病的小分子試劑可能會(huì)調(diào)節(jié)SARS-CoV-2的病毒-宿主相互作用。作為一種已經(jīng)批準(zhǔn)的免疫調(diào)節(jié)劑，氯喹顯示出對(duì)SARS-CoV-2的抑制作用（在Vero E6細(xì)胞中的EC50=1.13 μM），并且正在一項(xiàng)開(kāi)放標(biāo)簽臨床試驗(yàn)（ChiCTR2000029609）中進(jìn)行評(píng)估。氯喹阻斷病毒感染的機(jī)制是增加病毒/細(xì)胞融合所需的體內(nèi)pH，干擾SARS-CoV-2的細(xì)胞受體的糖基化。

3、已被批準(zhǔn)用于腹瀉治療的硝唑尼特（Nitazoxanide）也可以抑制SARS-CoV-2（Vero E6細(xì)胞中的EC50=2.12?μM）。這類(lèi)小分子試劑的抗病毒療效都需要在臨床研究中進(jìn)行評(píng)估。

其他潛在的有效藥物可能還有：核苷類(lèi)似物（如Fabiravir抑制病毒核苷酸生物合成），神經(jīng)氨酸酶抑制劑（如Zanamivir和Peramivir），融合肽（如EK1），Abidol，RNA合成抑制劑（如TDF、3TC），抗炎藥（如激素和其他化合物），部分中藥制劑等，均有待進(jìn)一步研究。

SARS-CoV-2基因組編碼非結(jié)構(gòu)蛋白（比如3-胰凝乳蛋白酶樣蛋白酶、木瓜蛋白酶樣蛋白酶、解旋酶、RNA依賴(lài)性RNA聚合酶）、結(jié)構(gòu)蛋白（比如刺突糖蛋白）和輔助蛋白。這四種非結(jié)構(gòu)蛋白是病毒生命周期中的關(guān)鍵酶，而刺突糖蛋白（S）對(duì)于病毒進(jìn)入細(xì)胞過(guò)程中的病毒-細(xì)胞受體相互作用是必不可少的。因此，這五種蛋白被認(rèn)為是開(kāi)發(fā)針對(duì)抗病毒試劑的誘人靶標(biāo)。

目前已有三項(xiàng)研究（Peng Zhou等、Michael等、Markus Hoffmann等）在細(xì)胞水平上證明了SARS-CoV-2病毒與SARS-CoV病毒一樣，通過(guò)宿主細(xì)胞受體ACE2進(jìn)入宿主細(xì)胞。而在蛋白酶切割Spike蛋白階段，可能與SARS-CoV一致，利用了宿主蛋白酶Cathepsin B/L或TMPRSS2來(lái)切割Spike蛋白介導(dǎo)進(jìn)入宿主細(xì)胞的過(guò)程。提示著ACE2和Cathepsin B/L或TMPRSS2作為抗SARS-CoV-2病毒藥物靶點(diǎn)的潛在價(jià)值。另外，GSK3在復(fù)制過(guò)程中對(duì)核蛋白磷酸化并協(xié)助病毒復(fù)制，hnRNPA1也在病毒RNA的合成過(guò)程中發(fā)揮作用；NL-GE對(duì)翻譯好的病毒刺突蛋白和膜蛋白進(jìn)行糖基化修飾；ER分子伴侶負(fù)責(zé)刺突蛋白的正確折疊。上述過(guò)程中的宿主蛋白也可能是SARS-CoV-2藥物研究的靶點(diǎn)。

與人ACE2分子（品紅色帶）相互作用的

SARS-CoV-2 S-蛋白的結(jié)構(gòu)模型